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1.養分的比例固定，難以滿足各類土壤和各種作物的需要。
2.各種養分在土壤中運動速率各不相同，被保持和流失的程度不同，因而在施用時間、施肥位置等很難滿足施肥技術上的要求。 我國的復合肥生產企業規模在年產100萬噸以上的很少，主要集中在山東、江蘇、湖北，目前知名品牌有山東紅日艷陽天、西洋、史丹利、芭田等，中國的復合肥正處于發展階段，農民對復合肥的認識也越來越深。
其他：復合肥的另一種肥料，BB肥的全稱是散裝摻混肥料，它是將幾種顆粒狀有單一肥料或復合肥料按一定的比例摻混而成的一種復混肥料。BB肥起源于美國，由于能源價格的上漲促進了BB肥的發展。生產和應用最多的是美國、日本、加拿大、和巴西,美國現有BB肥廠家8000家，產量占化肥消耗量的70%。我國目前BB肥廠家主要集中于在廣東、天津和江西等地，年總產量僅50多萬噸左右。
BB肥是今后肥料發展的方向，它的優點是：①養分全面,濃度高,&127;增產、節本顯著，針對性強。它的總養分一般在52%以上，而前市場上銷售的國產復混肥有效成分多在25%左右，進口復合肥養分總量多為45%-48%，&127;但進口復合肥養分比例(N：P2O5:K2O=15:15:15)磷配比例偏高，&127;造成養分較大的浪費。BB專用肥的養分配比是在考慮作物需肥特點的基礎上，參考當地土壤養分供給狀況而提出的，既有科學性，又有針對性。②加工簡便，生產成本低,無污染。③配方靈活，可根據作物營養、土壤肥力和產量水平等條件的不同而靈活改變，彌補了一般通用型復合肥因固定養分配比而容易造成某種養分不足或過剩的缺點。BB肥做基肥和追肥均可，因溶解性好，做基肥宜表施，不宜施過深土層;果、茶、菜等施用BB肥不宜撒施，宜條施和穴施，距種子和作物根系3～5&127;厘米，施后蓋土，追肥兌水施即可。畝施用量只要進口復合肥的60%復合肥是在一種化肥中，含有氮、磷、鉀三要素中兩種和兩種以上的肥料。含有任何兩種要素的復合肥料稱二元復合肥；同時含有三要素的肥料稱為三元復合肥。復合肥分為化成復合肥和混成復合肥。而混成復合肥是由兩種和幾種鹽按一定比例混合而成，制成的肥料是混合物。化成復合肥和混成復合肥在肥效上沒有太大的差異。常用的幾種復合肥：1.磷酸一銨主要成分NH4H2PO4有效成分%(N-P2O5-K2O)12-60-0適合各類作物，作基肥、種肥均可。作種肥要避免與種子接觸，用量也應減少。追肥應條施。2.磷酸二銨主要成分(NH4)2HPO4有效成分%(N-P2O5-K2O)21-53-0適合各類作物，作基肥、種肥均可。作種肥要避免與種子接觸，用量也應減少。追肥應條施。3.磷酸二氫鉀主要成分KH2PO4有效成分%(N-P2O5-K2O)0-24-27多用于根外追肥，濃度為0.2-0.3%。復混肥是以物理加工制成,氮、磷、鉀三種養分中,至少有兩種標明量的肥料。按其總養分含量可分為高濃度(≥40%)、中濃度(≥30%)、低濃度(≥25%)。
復合肥外觀一般為顆粒狀，由于生產工藝的不同，顏色也不盡一樣，他的主要原料有硫酸銨、硝酸銨、碳酸銨、氯化銨、尿素、硫酸鉀、氯化鉀、磷銨等等。
